MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 7227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002679	CGTT	2	8	26770	26777	0 %	50 %	25 %	25 %	13488056
502	NC_002679	T	6	6	26776	26781	0 %	100 %	0 %	0 %	13488056
503	NC_002679	TTC	2	6	26783	26788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488056
504	NC_002679	GCCG	2	8	26890	26897	0 %	0 %	50 %	50 %	13488056
505	NC_002679	CGG	2	6	26984	26989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488056
506	NC_002679	CCG	2	6	27020	27025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488056
507	NC_002679	TG	3	6	27118	27123	0 %	50 %	50 %	0 %	13488056
508	NC_002679	GC	4	8	27128	27135	0 %	0 %	50 %	50 %	13488056
509	NC_002679	ACC	2	6	27333	27338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488056
510	NC_002679	CGA	2	6	27427	27432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488056
511	NC_002679	ATC	2	6	27470	27475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488056
512	NC_002679	CTGG	2	8	27489	27496	0 %	25 %	50 %	25 %	13488056
513	NC_002679	GCG	2	6	27501	27506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488056
514	NC_002679	GTC	2	6	27542	27547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488056
515	NC_002679	CGC	2	6	27567	27572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488056
516	NC_002679	TCC	2	6	27593	27598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488056
517	NC_002679	TGGC	2	8	27615	27622	0 %	25 %	50 %	25 %	13488056
518	NC_002679	GAG	2	6	27655	27660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488056
519	NC_002679	TGC	2	6	27688	27693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488056
520	NC_002679	CGC	2	6	27907	27912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488056
521	NC_002679	ATC	2	6	27945	27950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488056
522	NC_002679	CAC	2	6	27982	27987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_002679	GCC	2	6	28034	28039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_002679	TTG	2	6	28041	28046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_002679	GAC	2	6	28087	28092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_002679	AGC	2	6	28109	28114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_002679	CGC	2	6	28184	28189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_002679	CGC	2	6	28212	28217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_002679	GC	3	6	28238	28243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_002679	TCT	2	6	28259	28264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_002679	GACAGA	2	12	28283	28294	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
532	NC_002679	GTC	2	6	28324	28329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_002679	TCC	2	6	28409	28414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488057
534	NC_002679	AGC	2	6	28532	28537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488057
535	NC_002679	GCT	2	6	28664	28669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488057
536	NC_002679	CGGCG	2	10	28826	28835	0 %	0 %	60 %	40 %	13488057
537	NC_002679	GC	3	6	28845	28850	0 %	0 %	50 %	50 %	13488057
538	NC_002679	TCC	2	6	28919	28924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488057
539	NC_002679	CAT	2	6	28957	28962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488057
540	NC_002679	CTC	2	6	28978	28983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488057
541	NC_002679	GTG	2	6	29036	29041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488057
542	NC_002679	CA	3	6	29078	29083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_002679	AG	3	6	29116	29121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_002679	GAG	2	6	29286	29291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488191
545	NC_002679	CAA	2	6	29410	29415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488191
546	NC_002679	GAT	2	6	29450	29455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488191
547	NC_002679	CGAA	2	8	29576	29583	50 %	0 %	25 %	25 %	13488191
548	NC_002679	CGC	2	6	29618	29623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488191
549	NC_002679	ATC	2	6	29637	29642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488191
550	NC_002679	GTCT	2	8	29679	29686	0 %	50 %	25 %	25 %	13488191
551	NC_002679	GAC	2	6	29765	29770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488191
552	NC_002679	CTG	2	6	29773	29778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488191
553	NC_002679	GGGT	2	8	29891	29898	0 %	25 %	75 %	0 %	13488191
554	NC_002679	CGG	2	6	29930	29935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488191
555	NC_002679	GAT	2	6	29936	29941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488191
556	NC_002679	GAG	2	6	29970	29975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488191
557	NC_002679	CTG	2	6	29992	29997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488191
558	NC_002679	GTG	2	6	29998	30003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488191
559	NC_002679	GC	3	6	30024	30029	0 %	0 %	50 %	50 %	13488191
560	NC_002679	ATT	2	6	30048	30053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488191
561	NC_002679	CAT	2	6	30089	30094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488191
562	NC_002679	TCA	2	6	30112	30117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488191
563	NC_002679	TCGA	2	8	30173	30180	25 %	25 %	25 %	25 %	13488191
564	NC_002679	TC	3	6	30344	30349	0 %	50 %	0 %	50 %	13488191
565	NC_002679	CGCGA	2	10	30381	30390	20 %	0 %	40 %	40 %	13488191
566	NC_002679	TGG	2	6	30539	30544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488191
567	NC_002679	ACG	2	6	30661	30666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488191
568	NC_002679	CGC	2	6	30685	30690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488191
569	NC_002679	GCC	2	6	30744	30749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488191
570	NC_002679	GATGCG	2	12	30806	30817	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13488191
571	NC_002679	GTT	2	6	30846	30851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488191
572	NC_002679	CGCC	2	8	30994	31001	0 %	0 %	25 %	75 %	13488191
573	NC_002679	CAG	2	6	31044	31049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488191
574	NC_002679	ATG	2	6	31096	31101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488191
575	NC_002679	TCC	2	6	31166	31171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488191
576	NC_002679	ATG	2	6	31223	31228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488191
577	NC_002679	GCC	2	6	31287	31292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488192
578	NC_002679	TCC	2	6	31305	31310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488192
579	NC_002679	TCC	2	6	31316	31321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488192
580	NC_002679	TTGG	2	8	31385	31392	0 %	50 %	50 %	0 %	13488192
581	NC_002679	CGC	2	6	31420	31425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488192
582	NC_002679	GTG	2	6	31490	31495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488192
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584	NC_002679	ACG	2	6	31533	31538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488192
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587	NC_002679	CGGG	2	8	31629	31636	0 %	0 %	75 %	25 %	13488192
588	NC_002679	CCT	2	6	31679	31684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488192
589	NC_002679	TCC	2	6	31731	31736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488192
590	NC_002679	GC	3	6	31791	31796	0 %	0 %	50 %	50 %	13488192
591	NC_002679	CG	3	6	31820	31825	0 %	0 %	50 %	50 %	13488192
592	NC_002679	A	6	6	31914	31919	100 %	0 %	0 %	0 %	13488192
593	NC_002679	TTC	2	6	32117	32122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488192
594	NC_002679	TTG	2	6	32188	32193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488192
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597	NC_002679	GGC	2	6	32402	32407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488192
598	NC_002679	ACG	2	6	32418	32423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488192
599	NC_002679	CGG	2	6	32469	32474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488192
600	NC_002679	CTC	2	6	32486	32491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488192
601	NC_002679	GA	3	6	32544	32549	50 %	0 %	50 %	0 %	13488192
602	NC_002679	TCGA	2	8	32606	32613	25 %	25 %	25 %	25 %	13488192
603	NC_002679	CGG	3	9	32650	32658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488192
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606	NC_002679	AG	4	8	32845	32852	50 %	0 %	50 %	0 %	13488192
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608	NC_002679	GGGCCG	2	12	33019	33030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488193
609	NC_002679	AAC	2	6	33202	33207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488193
610	NC_002679	ATC	2	6	33211	33216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488193
611	NC_002679	GACCC	2	10	33265	33274	20 %	0 %	20 %	60 %	13488193
612	NC_002679	AGA	2	6	33305	33310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488193
613	NC_002679	CCT	2	6	33315	33320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488193
614	NC_002679	TGA	2	6	33500	33505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488193
615	NC_002679	CTC	2	6	33575	33580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488193
616	NC_002679	CCA	3	9	33581	33589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488193
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618	NC_002679	GTCG	2	8	33652	33659	0 %	25 %	50 %	25 %	13488193
619	NC_002679	GCAG	2	8	33681	33688	25 %	0 %	50 %	25 %	13488193
620	NC_002679	TTC	2	6	33689	33694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488193
621	NC_002679	CGG	2	6	33696	33701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488193
622	NC_002679	GC	3	6	33884	33889	0 %	0 %	50 %	50 %	13488194
623	NC_002679	CGA	2	6	33977	33982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488194
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625	NC_002679	CGA	2	6	34051	34056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488194
626	NC_002679	CGG	2	6	34094	34099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488194
627	NC_002679	CAA	2	6	34118	34123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488194
628	NC_002679	GCT	2	6	34146	34151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488194
629	NC_002679	TC	3	6	34162	34167	0 %	50 %	0 %	50 %	13488194
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631	NC_002679	GTC	2	6	34291	34296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488194
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